Obszar Doliny Liwca na całej swojej długości, na podstawie tzw. Dyrektywy Ptasiej, zaliczany jest do europejskiej sieci ochrony przyrody Natura 2000. Na terenach tych wystepują zespoły lęgowe ptaków objętych ochroną całkowitą i częściową, a także gatunki zaliczane do rzadkich, takie jak: cyraneczka, cyranka, czajka, bocian biały, krzyzówka, błotniak stawowy, derkacz, sieweczka rzeczna, rybitwa czarna, podróżniczek, strumieniówka, ortolan.